يستقبل المعهد القومي لعلاج الأورام بمدينة صبراتة المرضى من عموم ليبيا ويعمل بعدة أقسام علاجية وتشخيصية، ويفتقر المعهد إلى قسم الإيواء السريريّ وقسم العمليات الجراحية.
ويعمل المعهد بعدة أقسام بالعيادات الخارجية منها قسم العلاج الكيماوي حيث يستقبل حوالي 80 حالة يومياً من رجال ونساء لأخذ الجرعات الكيماوية بالقسم، وقسم العلاج الإشعاعي وهو يعمل بكامل طاقته على توفير العلاج لجميع مرضى المنطقة الغربية والجنوبية.
ويوجد بالمعهد فندق إيواء لتوفير السكن للمرضى القادمين من المدن البعيدة وخصوصاً الجنوبية وكذلك يعمل قسم الإشاعة التشخيصية بكامل طاقته حيث يقوم بتصوير المرضى للتشخيص لأكثر من 100 حالة يومياً، كما يوجد بالقسم جهاز للرنين المغناطيسي وجهاز التصوير بالكمبيوتر وجهاز الموجات فوق الصوتية.
ويقّدم المعهد خدماته للتخفيف على المرضى والمصابين بأمراض الأورام وعلاجها وإعطاء جرعات الكيماوي اللّازمة والإشعاع التشخيصي والعلاجي للمرضى والمصابين.